Севастопольский ученый совместно с коллегами из Германии и Франции разработал математическую модель, которая позволяет на основе анализа генома бактерий восстановить их эволюционную историю. Научная статья ведущего научного сотрудника Института перспективных исследований Севастопольского госуниверситета Михаила Шейнмана о моделировании эволюции бактерий опубликована в американском научном журнале Proceedings of the National Academy of Sciences, сообщает портал СевГУ.
Исследования проводятся в рамках программы стратегического академического лидерства «Приоритет 2030». Михаил Шейман пояснил, что, несмотря на то, что геномы десятков тысяч штаммов бактерий уже прочитаны, применить математическую модель к их эволюции было сложно из-за того, что эволюция этих микроорганизмов отличается от эволюции геномов многоклеточных.
«Молекулярные часы, где каждая мутация — это «тик», у одних идут быстрее, а у других медленнее. Поэтому, сравнивая геномы бактерий, мы видим мешанину из разных кусков, имеющих разную эволюционную историю. Получается, что геном — это сложно составленная мозаика. Как узнать, где кончается один кусок и начинается другой? Бактерии об этом не «расскажут». Однако с помощью этого нового метода можно сравнить статистические свойства геномов и сравнить с тем, что предсказывает модель, попутно подогнав параметры модели. Таким образом стало возможным напрямую по бактериальным геномам оценить время расхождения бактериальных видов и оценить насколько часто они обмениваются генами после расхождения», — рассказал Михаил Шейнман.
